1 、骨髓造血干细胞：包括自体骨髓移植和异体骨髓移植。异体骨髓移植又分为同基因骨髓移植(同卵双胞胎之间)和异基因骨髓移植。异基因骨髓移植又可分为：血缘关系骨髓(同胞兄弟姐妹)移植与非血缘关系骨髓(志愿捐髓者)移植。自身骨髓移植易复发，在临床中较少采用。目前骨髓移植主要还是异基因的骨髓移植。
2 、外周造血干细胞：包括自体外周血干细胞移植和异基因外周血干细胞移植。外周血中干细胞数量很少CD34+细胞仅占0.01％～0.09％)，采集前须使用粒细胞集落刺激因子(G-CSF)等细胞因子将干细胞从骨髓动员到外周血。通过采集经过动员后的外周血中的造血干／祖细胞作为移植物移植给受者，使其建立起正常的造血与免疫功能。
3 、脐带血造血干细胞：脐血干细胞移植、胚胎干细胞移植、混合干细胞移植，脐血中干细胞含量与骨髓相似(CD34+T细胞仅占2.4％)，其增殖能力强，HLA表达较低，免疫原性弱，容易达到免疫重建，且来源方便，可以部分代替同种异体骨髓移植。
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